Hinter dem Hauptaltar der Pelagiuskirche liegt eine halb eingegrabene (früh) romanische Krypta, die einzige ihrer Art in Istrien und eine der wenigen in ganz Kroatien.
Die Krypta ist dreischiffig, mit starken Kreuzgewölben und zwei kleinen, überwölbten Räumen in den toten Ecken, im zentralen Teil steht die Confessio (Raum mit Heiligengrab), die eine Inschrift mit dem Namen des Bischofs Adam aus dem Jahr 1146 trägt.